| 1. | Rui Sousa (POR, Efapel Glassdrive) | 3:58:32 |
| 2. | Sérgio Ribeiro (POR, Efapel Glassdrive) | 0:03 |
| 3. | David Blanco (ESP, Efapel Glassdrive) | 0:03 |
| 4. | David De La Cruz (ESP, Caja Rural) | 0:03 |
| 5. | Hugo Sabido (POR, LA Alumínios Antarte) | 0:03 |
| 6. | José Mendes (POR, LA Alumínios Antarte) | 0:10 |
| 7. | Brice Feillu (FRA, Saur - Sojasun) | 0:16 |
| 8. | Nuno Ribeiro (POR, Efapel Glassdrive) | 0:22 |
| 9. | Daniel Silva (POR, Onda) | 0:27 |
| 10. | Omar Fraile (ESP, Orbea Continental) | 0:27 |
| 11. | Nelson Vitorino (POR, Carmim Prio) | 0:27 |
| 12. | Darwin Atapuma (COL, Colombia - Coldeportes) | 0:27 |
| 13. | Vergílio Santos (POR, LA Alumínios Antarte) | 0:27 |
| 14. | César Fonte (POR, Efapel Glassdrive) | 0:27 |
| 15. | Edgar Pinto (POR, LA Alumínios Antarte) | 0:45 |
| 16. | Garikoitz Bravo (ESP, Caja Rural) | 0:49 |
| 17. | David Livramento (POR, Carmim Prio) | 0:53 |
| 18. | Sérgio Sousa (POR, Efapel Glassdrive) | 0:55 |
| 19. | Moises Dueñas (ESP, Burgos BH / Castilla e Leon) | 0:55 |
| 20. | Ricardo Mestre (POR, Carmim Prio) | 0:55 |
| 21. | Mikhail Antonov (RUS, Lokosphinx) | 1:14 |
| 22. | Jordi Simon (ESP, Andalucia) | 1:18 |
| 23. | Mikel Bizkarra (ESP, Orbea Continental) | 1:18 |
| 24. | Maxime Mederel (FRA, Saur - Sojasun) | 1:27 |
| 25. | Jonathan Clarke (AUS, United Healthcare) | 1:39 |
| 26. | Joni Brandão (POR, Burgos BH / Castilla e Leon) | 1:45 |
| 27. | Alexander Rybakov (RUS, Itera Katusha) | 1:45 |
| 28. | Hélder Oliveira (POR, Onda) | 1:49 |
| 29. | Rui Vinhas (POR, Portugal) | 2:05 |
| 30. | Ricardo Vilela (POR, Efapel Glassdrive) | 2:05 |
| 31. | Márcio Barbosa (POR, LA Alumínios Antarte) | 2:05 |
| 32. | Delio Fernandez (ESP, Onda) | 2:20 |
| 33. | Célio Sousa (POR, Onda) | 2:25 |
| 34. | Juan Suarez (COL, Colombia - Coldeportes) | 2:40 |
| 35. | Darren Lill (RSA, Team Bonitas) | 2:51 |
| 36. | Pavel Ptashkin (RUS, Lokosphinx) | 2:53 |
| 37. | Eloy Ruiz (ESP, Andalucia) | 2:53 |
| 38. | Alejandro Marque (ESP, Carmim Prio) | 3:05 |
| 39. | Filipe Cardoso (POR, Efapel Glassdrive) | 3:05 |
| 40. | Marc De Maar (AHO, United Healthcare) | 3:17 |
| 41. | Daliver Ospina (COL, Colombia - Coldeportes) | 3:23 |
| 42. | Sergey Belykh (RUS, Lokosphinx) | 3:31 |
| 43. | Andres Vigil (ESP, Andalucia) | 3:35 |
| 44. | Nicolas Capdepuy (FRA, Burgos BH / Castilla e Leon) | 3:41 |
| 45. | António Amorim (POR, Efapel Glassdrive) | 3:57 |
| 46. | José Gonçalves (POR, Onda) | 4:04 |
| 47. | Jacques Van Rensburg (RSA, MTN Qhubeka) | 4:32 |
| 48. | Hugo Sancho (POR, LA Alumínios Antarte) | 4:46 |
| 49. | João Cabreira (POR, Onda) | 5:09 |
| 50. | Amaro Antunes (POR, Carmim Prio) | 5:18 |
| 51. | Henrique Casimiro (POR, Carmim Prio) | 5:18 |
| 52. | Domingos Gonçalves (POR, Onda) | 5:18 |
| 53. | Jesus Del Pino (ESP, Caja Rural) | 5:22 |
| 54. | Ricardo Ferreira (POR, Portugal) | 5:27 |
| 55. | Jason Bakke (RSA, Team Bonitas) | 5:36 |
| 56. | Aritz Bagües (ESP, Orbea Continental) | 5:51 |
| 57. | Wilson Marentes (COL, Colombia - Coldeportes) | 5:53 |
| 58. | Alexey Ribaikin (RUS, Lokosphinx) | 5:58 |